Aidez le maire de Mouse City à nettoyer la ville de l'invasion de chats noirs dans ce jeu de bubble ionnant où vous utiliserez une trappe à souris en guise de canon à boules. Vous débuterez à l'opéra avant de vous attaquer au nettoyage du parc de la ville, de son musée, des quais, de la gare, ... Terminer un niveau ne sera pas suffisant et vous devrez obligatoirement tenter d'accumuler un maximum d'étoiles afin de débloquer les nouveaux lieux; optimisez pour cela votre score en réussissant de longues séries de combo et en doublant votre score avec des rebonds. Bubble Mouse propose également un mode challenge, prenant place dans une boutique de bonbons, afin de débloquer diverses boules bonus. Au final ce sont pas moins de 98 niveaux et 6 mondes différents qui vous attendent dans ce jeu de bubble grandiose.
